REKLAMA

Tysiące ludzkich mózgów gromadzone od lat 50. Jakie są zbiory w warszawskim Instytucie Psychiatrii i Neurologii?

Homo Science
Data emisji:
2021-07-24 13:40
Audycja:
Czas trwania:
25:05 min.
Udostępnij:

To bezcenny zbiór służący lekarzom i naukowcom do badania zmian, jakie zachodzą w tym najważniejszym z naszych organów. Teraz ta kolekcja została zdigitalizowana i udostępniona w ramach projektu Digital Brain. Rozmawiamy z jego koordynatorem dr. Tomaszem Stępniem

AUTOMATYCZNA TRANSKRYPCJA PODCASTU

Transkrypcja podcastu
dzień dobry państwu witamy w audycji Homo science przy mikrofonie Aleksandra Stanisławska Piotr Stanisławski Crazy nauka PL jest z nami zdanie gość dr nauk medycznych Tomasz Stępień z Instytutu psychiatrii i neurologii w Warszawie tym dobrym bardzo miło nasz gość jest koordynatorem projektu Digital Brain, w ramach którego Instytut psychiatrii i neurologii udostępnia cyfrowe kopie pierwszego polskiego banku mózgów no i o tym projekcie chcemy porozmawiać dzisiaj pierwsze pytanie, Rozwiń » jakimi się tutaj nasuwa co to jest ten bank mózgów w Instytucie brzmi trochę groźnie przyznam szczerze, ale były zupełnie do oswojenia ktoś nas kolekcja mózgu, którą zaczęliśmy zbierać w latach pięćdziesiątych na początku lat rządów mieszankę trzecim roku wzrost to ska rozpoczęła to wydarzenie podróżując po Europie przywiozła ten element schemat ubraniowe do Polski samą ideą kolekcjonowania także materiału po diagnostyce euro patologicznej no i tak kolejne pokolenia Europa teologów ciągnął to do dnia dzisiejszego bez dużym sukcesem oczywiście, żeby sama idea sama idea funkcjonowania takiego materiału polega na tym, że po diagnostyce materiałów rozwój zostaje do kolejnych badań, a z uwagi na to za zna, a to kryzys rozwija i wciąż pojawiają się nowe nowe metody diagnostyczne to można do tego materiału retrospektywnie wracać i noga analizować to co my robimy w naszym projekcie Digital Green to rewitalizuje od cywili, niemniej Niemcy tylko przerabiamy na formę cyfrową po to, żeby mógł wystawić do sieci do do użytku tak naprawdę do wglądu, bo to z tego można korzystać zarówno kopie cyfrowe jako materiał biologiczny tak to co mamy sprzyjało to wam przyświecało przy przetwarzaniu zrębów i założeń całego projektu to, żeby móc wystawić sieci to na co można popatrzeć NATO oraz mocy jechać do przejechać powiedzmy bardzo precyzyjnie projekt tytułem projektu założeniami wnioskiem zgodę komisji bioetycznej tak dalej itd. zgłosić się do nas z konkretnymi badania te chciałem spytać ci co w tej chwili można wyczytać z takich starych mózgu bądź to trochę kojarzyć jest oczywiście wiem, że błędne ale, ale zaryzykuję właśnie takim trochę jak za Darwina kolekcjonowaniem, że tu swoją formalną lub innym płynem coś sobie pływa możemy się podejmować jakieś dziwne, tak więc po pierwsze, co z takich mózgu, zwłaszcza tych starych, które nie to, że na bieżąco badamy apotem konserwujemy można jeszcze odczytać po drugie, co można odczytać cyfrowo, bo jednak co innego analiza na poziomie mikroskopowym czy coś tu możemy pooglądać obrazki takich ładnych plasterków dokładnie dokładnie tak to co skąpić cyfrowych możemy, ale nie mieli, więc tylko czytać to co to, jakie struktury w posiadaniu banku są tak czy, jeżeli ktoś zajmuje się chorobą Huntingtona to, czego na naszą kolekcję wolta cytowany przez chorobę Huntingtona określonymi, rozpoznając licznymi cała baza zbudowana jest jakby zjechał z walkami rozpoznania nic na euro patologiczne tam jeszcze jest wiek płeć dalsze zmiany można wprowadzać więcej także przez taką klasą oraz wyszukiwarkę Glovo wykluczeniami kontynuatorami, ale jeśli przeglądamy to ten, kto nas biuro jesteśmy w stanie wybrać dowiedzieć się czy chociażby czy choroby Huntingtona zwoje podstawy jądro ogoniaste czy to struktury, które nas interesują wbrew zanikają, które są w trakcie choroby upośledzona czy są w naszym posiadaniu, więc jeżeli państwo macie projekt z zabawy w muzyce lub cywilne placówki na tego typu badania uzyskuje taką grupę u nas materiału zgłaszać się do nas zależność zainteresowani współpracą naukową w ramach takiego takiego projektu i wówczas już zaczynamy zacząć współpracę tak na materiale materiał biologiczny jeśli chodzi o materiały cyfrowe to po części powiedziałem to jest taka nasza wizytówka tego co mamy, bo z uwagi na to, że wiele wiele placówek, żeby z Polski świata z zwracać do nas czy to na ramach współpracy naukowej zazwyczaj takiej po konkurencyjnej z ulicy poprzez lekarz artykuły naukowe my jesteśmy w stanie proszę wszystkich wpuścić do archiwum i żadnego bezpieczeństwa i organizacyjnych i wielu wielu innych, a wystawienie tego w sieci pomaga prasa udrażnia cały cały proces, więc kopie cyfrowe są po to, żeby móc wiedzieć co jest naszym jak atak biologiczny jaki, jakie struktury z Moskwy są w naszej kolekcji natomiast chodzi o sam materiał cyfrowych uwagi na to, że składa się ją z zdjęć fragmentów mózgu po sekcji euro patologie w walce z bloczków parafinowych, czyli tych fragmentów, które zostały pobrane z mózgu do diagnostyki dalsze i skanów preparatów to tutaj jakby spektrum możliwości diagnostyczne przy ulicy edukacji rezydentów patomorfologów patologów Europa kolorów jest już jest z serca no oczywiście jest to co to szalenie istotne to na co się nad ustawą oczywiście w pamięci algorytmy służące ewidencji i wykorzystania tego materiału do analiz zasad do tego wątku oczywiście jeszcze wrócimy do sztucznej inteligencji do wielu wątków, które pan poruszył natomiast nieco, porządkując wiedzę wstępną na temat tego, jakie mózgi znajdują się w tym banku mózgu w Instytucie są to fragmenty tkanki pobranej od osób, które cierpiały na określone schorzenia jeszcze są to pobyt po czy to są fragmenty pobrane od osób, które żyły czy to są fragmenty pobrane od osób, które już zmarły jak to wygląda w tej bazie cały materiał materiał post mortem, mimo że gorąco zabiega o oddawanie zażyć za mogą niestety nie znajduje chętnych natomiast, choć prosiłem oczywiście babki tak natomiast cały materiał, który nie jest zawiezie nas bardzo to jest materiał post mortem to jest materiał jeśli mielibyśmy spojrzeć na to jak jednostki chorobowej to jest rosła normalny z populacji tak, czyli grą to są choroby naczyniopochodne choroby neurodegeneracyjne nasze społeczeństwo tylko nasz europejski światowy staje się bardzo bardzo szybko i choroby typu choroba Alzheimera oczywiście Atkinsona choroba Huntingtona, ale też zawsze chorobę tak jak choroba Wilsona przekleństwa Jacoba także mamy czasem znacznym związane z 1 strony to co się pojawia w populacji, a z drugiej strony to, jakie są kierunki naukowe badawcze także instytucja w związku z tym, że choroba wyzwala Jacoba wiele wiele lat ze spraw oraz Piłsudskiego prowadzona i pacjenci do Instytutu przyjeżdżali jest bardzo chorobę Wilsona to profesor członkowska cały czas aktywna i pacjenci także także w Instytucie byli są prowadzeni więc, jakby zainteresowania bardzo bardzo szerokie i oczywiście to jest rzadkie zatruta akcje PAK 6 cali i to wszystko co można znaleźć na świecie, a jak to się państwa przechowuje oznaczenie cyfrowe, bo to się domyślić, ale mówił pan w bloczkach parafinowych okej no przychodzi taki mózg do państwa, że tak powiem tak co się z nim dzieje jak jest przetwarzany jak jest przechowywany skoro od lat pięćdziesiątych są mózgi dom musi być dobre skuteczne przechowywanie mózg przyjeżdża do zakładu euro patologii z oferowanym rozważają formalne to jest z idea koncepcja założenia mówi o tym, żeby to była pięciokrotność objętości mogło na przynajmniej przez 2 tygodnie musi się utrwala także by móc funkcjonować we and Moss, dlatego że mózg po pobraniu jest bardzo delikatny tutaj albo nie mieć składało się dobrze rok no bo tych 2 tygodniach zmienia to chyba asystenci i pewnie daje daje dobrze dobrze kroić zmienia konsystencję i wykonujemy sekcji Europa ekologiczna metodą mają na to są kolejne co projekt celowe tak dziesięcio milimetrowe plastry o ciała do potylicy i rozkładamy PL tt Plast cały ten most i szukamy zmian euro patologicznych oczywiście w oparciu o jakich prezesi są choroby i to co wiemy o pacjencie natomiast jeśli jest coś, czego nie wiemy, bo o pacjencie nie znamy jego przyczyny zgonu to czas pobieramy te fragmenty z wielu struktur po to, żeby dowiedzieć się znaleźć, niemniej nie tylko przyczynę zgonu tak było w przypadku chorób neurodegeneracyjnych wielu wielu innych schorzeń to widzimy tutaj są Soły algorytmy pobrania i wiemy co zapobiega w przypadku chorób naczyń pochodnych też widać to gole mogą potwierdzamy to, dlatego że Europa dzisiaj pod odblaskowe, ale tutaj jest wszystko jasne, jeżeli nie widzimy nie ma dziś przesłanek z choroby z sieci kryzys historie choroby wówczas działamy trochę detektywistycznej i szukamy tego Salus to jeszcze dopytam, bo przeglądałem oczywiście te zdjęcia i czasami to są takie bardzo eleganckie plastry, a czasami wygląda na trochę taką się tkankę to znaczy jest jakiś kawałek jak to się kompletnym ignorantem 9 też zadaję ignorancję pytania, ale wyglądam mam różne spostrzeżenia, o co chodzi czemu tak różne te obrazy dokładnie dokładnie tak trochę nawiązuje do tego co odpowiedział, że momentem z niektórych placów pobieramy fragmenty innych nie pobieramy te, które stoły, a w całości klasy notowane są nowe bardziej bardziej schludnie, ale z uwagi na to, że z wielu struktur pobieramy z placu pobieramy fragmenty pewnie wszystkich klasach demonstrowane są inwestowane są co strukturę co innego pobieramy płatów czołowych 1 obieramy ze zwoju płatach czołowych nie będzie woli tak dalej tak, ale w związku z tym musimy pamiętać, że dziennie strony odbiorca bardzo szeroki, więc tych tych kopii cyfrowych natomiast my staramy się jednak dotrzeć do lekarzy naukowców będą zainteresowani bezpośrednią materiał biologiczny w związku z tym zdecydowaliśmy, że mimo, że także, które są są pobrane tak jak to kwadratowe wycinki w recepcji trójkątne to zresztą rzetelnych płatów czołowych będziemy raczej życzeniowy czy innych słów będzie rewitalizować, dlatego że ktoś może znaleźć tam coś dla siebie nowej nie mamy w przekroju mamy wycięto płat swoje podstawy to być może jest zmiana logo miasta czy coś co mogę kogoś zainteresuje czy diagnostyce innych chorób neurologicznych a w jaki sposób ta kolekcja zdigitalizowane, jakie dane trafiają do kolekcji cyfrowej Digital broń mamy tam zdjęcia przekrojów mózgu ma zdjęcia bloczków parafinowych i skany preparatów, a także rozpoznania Europa ekologiczna i kliniczne protokołu na euro patologiczne nas oczywiście cała kolekcja nie zawiera żadnych danych wrażliwych danych danych osobowych osoby nie są identyfikowalne absolutnie we nie podlega żadnej ustawie o danych osobowych RODO europejskich tak dalej jeszcze tylko na koniec pierwszej części, gdzie to można zobaczyć, bo to może zobaczyć każdy tak nie tylko specjaliści lekarze to jest otwarta bardzo to jest baza otwarta chcieliśmy otworzyć ma na wszystkie grupy zainteresowane Urosa społecznej auto tonęło nauką to jest adres strony znajduje się na domenie Instytutowi to jest Digital Green pisane łącznie krótka i krok ego krótka PL gorąco zapraszam to my jeszcze i PIN, a Instytut psychiatrii i neurologii tak dokładna trasa nazwa tylko, że znajdą państwo też ten adres na Facebooku Crazy nauki we wpisie zapowiadającym to rozmowy tam można sobie kliknąć będzie prości, a naszym gościem jest dzisiaj dr n. med. Tomasz Stępień z Instytutu psychiatrii neurologii w Warszawie rozmawiamy o koordynowane przez niego projekcie Digital broń na drugą część rozmowy zapraszamy po informacjach Radia TOK FM witam państwa ponownie druga część audycji Homo science ponownie Aleksandra Stanisławska Piotr Stanisławski Crazy nauka PL i wciąż się z nami nasz gość dr nauk medycznych Tomasz Stępień z Instytutu psychiatrii i neurologii w Warszawie koordynator projektu Digital Brain dzień dobry dzień dobry, a cały ten Digital Brain w ogóle fascynujące projekt, bo to jest coś co się zaczęło jeszcze wtedy nie Digital w latach pięćdziesiątych jak pan opowiadał w poprzedniej części, kiedy zaczęto w Instytucie kolekcjonować kolekcjonować tak brzmi bardzo płakałem hobbystycznie wszelkiego typu mózgi chodziło po prostu o to, żeby mieć do badań przy różne przypadki można powiedzieć tak różne patologie i nie tylko, które zachodzą w mózgu, a to co się wydarzyło teraz właśnie te z zdigitalizowane, czyli niemym ucyfrowienie tych zbiorów po to, żeby one były dostępne dla każdego, bo powiedzmy wglądu natomiast szczególnie dla naukowców specjalistów, którzy chcieliby sobie z tego może być katalogu mózgów coś wybrać coś co pasuje do ich badań coś co jest szczególnie potrzebne no właśnie tutaj nasuwa się pytanie o zastosowania tej kolekcji do czego można wykorzystać informacje, które będą pochodziły właśnie czy pochodzą z już kolekcji Digital Brain, więc to co sądzą nam przyświeca psy przez realizacji projektu to i przy tych planach nasze przyszłościowe to zaciągnięcia algorytmów sztucznej inteligencji do rozpoznania Europa to logiczne jakby w sztuce inteligencji Machine learningu dzieje się dość sporo w ostatnich latach szczególnie na takim wąskim gardłem nie jest zawsze materiał diagnostyczny tak jak dużo jest prac publikowane i fajne sukcesy przy diagnostyce chorób skóry raka prostaty sutka płuc tak w przypadku chorób ośrodkowego układu nerwowego nie, dlatego że tych zbiorów materiału Europa to logiczne jest mało w związku z tym mamy tematu u siebie i staramy się go poszerzać, a wykorzystać w kolejnych konkursach kolejnych wnioskach, o które będziemy będziemy aplikować te wejdą słowo tutaj zapytam dopytam jeszcze czy to będzie wyglądało tak wygląda już tak, że ktoś jakiś ośrodek na świecie uzyska obraz mózgu swojego pacjenta będzie mógł pobrać się z kolekcji Digital Brain do porównania jakieś obrazy, które podpowiedzą, jaka może być diagnoza, jaka to jest jednostka chorobowa, którą cierpi ten pacjent dokładnie taki to można robić już już teraz z bazy naszej można można pobierać podglądać te materiały i konkretne rozpoznania względne naukowca lekarza na świecie mają jakieś wątpliwości co do rozpoznania wówczas możemy posiłkować, jakimi obrazami taka jest idea tego, żeby one pomagały też diagnostycznie, ale też i pomagałem przy edukacji i sztuczna inteligencja miałaby usprawnić ten proces w proponowaniu chorób sztuczna inteligencja miałaby nam dać trochę wdrożyć ten ten cały proces neurologów w Polsce jest kilkudziesięciu to jest naprawdę naprawdę garstka i badania i statystyki dowodzą, że skuteczność leczenia jest mocno skorelowana z miejsca dziś choruje tak z dostępnością terapii po prostu, więc jeżeli mamy ośrodek, który prowadzi diagnostykę prowadzi badania mamy większą szansę sukcesu ma się teraz w związku z tym na hali chociażby pandemii sars-cov 2 jak zastosowanie algorytmów system ewidencji pomaga trochę uniezależnieniu się od drugiego człowieka taki dostajemy obrazy z materiału Europa logicznego i wówczas algorytmicznych inteligencji analizują oczywiście nauczone na na bazie poprzedniej zmiany w mózgu i stawiają bardzo wysokim prawdopodobieństwem rozpoznania w przypadku chorób skóry jest 88%, gdzie po to, rywalom to jest 93% tutaj chodzi czas będzie chodzi nie wchodzi wypalenie zawodowe zmęczenie tak dalej rosół mamy bazę, która jest w stanie pracować 24 cha a jaka będzie przyszłość tej tego projektu do czego państwo jako naukowcy jako twórcy Digital Brain będą dążyć w najbliższej przyszłości, więc 3 takie ścieżki rozwojowe widzę dla nas to tworzy, jakiego cha takiego centrum Europa ulicznego w Polsce tak, żeby móc skonsolidować zbiory, które gdzieś tam ktoś w różnych ośrodkach naukowych medycznych kolekcjonuje i wówczas to digitalizować 0202. plan który, który ma na najbliższe lata to algorytmy sztucznej inteligencji i rozpoznania euro patologiczne tak, żeby móc z 1 strony rozwinąć gałąź nauki i medycynę, a z drugiej strony udrożnić słucha cały proces diagnostyczny no i tematy ostatni to stworzenie takiego banku pobrania owego, gdzie 1 półkula mózgu trafia do formaliny druga trafia do zamrażarki niskotemperaturowej i wówczas musiał soczyście formularze zgody GE re wydarzenie tak jak ma to miejsce na na świecie też chcielibyśmy to rozwijać każdy z krajów europejskich ma bio bank my także chcielibyśmy z uwagi na to, że pacjentów szczególnie za pacjentów w Instytucie psychiatrii neurologii zjawia się wielu jesteśmy ośrodkiem referencyjnym, lecz za pacjenci z całej Polski mamy auto prowadzi oczywiście dużą wygląda to na ogromny projekt już to co zostało wykonane co jest jeszcze w planach jeszcze więcej z czego to jest wszystko finansowane to są fundusze unijne około 85% pochodzi z funduszy europejskich oraz około 15% z budżetu państwa to realizowane jest organizowany przez ministerstwo cyfryzacji agendą rządową, która dystrybuuje środki jest centrum projektów Polska cyfrowa fantastyczna grupa osób zaangażowanych czeskie projekt bardzo bardzo pomocna i przede wszystkim kompetentna to jest wszystko dobrze dobrze realizowane takie bardzo praktyczne pytanie, bo jak mówiliśmy poprzedniej części każdy może sobie przejrzeć to co tam jest zgromadzone jak zdjęcia były robione jak to w ogóle przebiegało to jest ogromna masa tego to jest jakiś jednak dość delikatny materiał tonie to, że nie wiem fotografujemy, jaki suszone roślinki te delikatne, ale inaczej jak to przebiegało, więc trzeba pamiętać, że materiały 1EUR patologiczne formalnie nowy poseł opary formaliny w związku z tym musieliśmy zakupić stoły sekcyjne tak jest wyciągiem dolnym po to, aby móc, żeby móc materiał diagnostyczny fotografować, a i uprzednio nie umieszczać go w dawnej łaźni Wodnej półkach żeby, żeby osoba wykonująca projekt mogła w ogóle to to zrobić, bo tak jak policzyliśmy swej masie w ilości naszych mózgów zajęlibyśmy chyba wszystkie zlewozmywaki Instytucie psychiatrii neurologii i jak ten proces nie dałoby się go zupełnie zupełnie przeprowadzi za występy zostały sekcje z dolnym wyciągiem pozwalają na to, żeby robić zdjęcia materiału forma nowego bez uprzedniego opłukania w tych samych miejscach materiał Parafianowicz bloczki pobrane z Moskwy są likwidowane i zakupione z projektu zostały także rozkopy skanujące i to jest materiał i to jest materiał diagnostyczne preparaty mógłbym państwu nawet pokazać jak wyglądają z uwagi na to, że nasze preparaty nie są standardowe tylko czy to nie jest taki materiał na małych rynkach tylko także na duży, bo na zasobach mamy także takie duże preparat pułku Love cała półkula mózgu jest na szkiełku po wskazujemy całość ubrana bardzo bardzo imponująca jednocześnie nie mogliśmy standardowy skanerów, które zawsze tylko mikroskopy, skazując to o jeszcze na sam koniec proszę przypomnieć adres, pod którym można zobaczyć to akwen każdy może zobaczyć stało to dzieło Digital Brain grą zapraszamy na stronę www Digital Brain kropkę i 5 kropkę et Group kpl świetnie i również na Facebooku okres nauki Zajaca audycji znajdą państwo ten adres dziękujemy naszemu gościowi, którym był dzisiaj dr n. med. Tomasz Stępień z Instytutu psychiatrii neurologii w Warszawie, który koordynuje ten wielki projekt dziękuję bardzo, bardzo dziękuję i zapraszamy państwa oczywiście na stronę projektu, a poza tym naszą audycję co sobotę 1340 i na stronę Crazy nauka PL, a teraz czas na informacje Radia TOK FM Zwiń «

PODCASTY AUDYCJI: HOMO SCIENCE

Więcej podcastów tej audycji

REKLAMA

POPULARNE

REKLAMA

DOSTĘP PREMIUM

Słuchaj wszystkich audycji Radia TOK FM kiedy chcesz i jak chcesz - na stronie internetowej i w aplikacji mobilnej!!

Dostęp Premium

SERWIS INFORMACYJNY

REKLAMA
REKLAMA
REKLAMA