REKLAMA

O cyfrowym zielniku tworzonym przez trzy pomorskie uczelnie

Homo Science
Data emisji:
2021-10-16 13:40
Audycja:
Czas trwania:
24:38 min.
Udostępnij:

AUTOMATYCZNA TRANSKRYPCJA PODCASTU

Transkrypcja podcastu
dzień dobry państwu witamy w audycji Homo science przy mikrofonie Aleksandra Stanisławska Piotr Stanisławski Crazy nauka PL będziemy dzisiaj rozmawiać, a takim przedsięwzięciu 3 polskich pomorskich wyższych uczelni, która ma na celu stworzenie cyfrowego zielnika nosi to tytuł herbarium Pomeranii com i ma ambicję stać się pierwszym ogólnopolskim Dziennikiem cyfrowym, a gościmy dzisiaj u siebie przedstawiciela i 2 z tych wyższych uczelni, a mianowicie prof. Piotra Niedzielskiego Rozwiń » z Akademii Pomorskiej w Słupsku oraz Uniwersytetu szczecińskiego dzień dobry panu witam panią redaktor witam wszystkich państwa dodam jeszcze, że w trzecim uczestnikiem tworzenia tego zielnika jest Uniwersytet Gdański, a to wszystko obsługuje od strony TV cyfrowej firma Hewlett Packard Enterprise także myślę, że możemy przystąpić do najważniejszego pytania co to jest cyfrowy zielnik, bo wszyscy kojarzymy te silniki takie chyba nawet część z nas robiła dziś w podstawówce tak po prostu się coś suszy w książce wkleja ostrożnie, żeby nie połamało opisuje, ale zakładam, że to jednak coś więcej troszeczkę tylko coś więcej, bo rzeczywiście to jest trochę tak jak w tym zielnik, który znamy, gdzie w szkołach zbieraliśmy właśnie słyszeliśmy ostrożnie tak samo jest w tej chwili Nika, które gromadzą od lat i to nawet można powiedzieć, że mamy zbiory, które mają kilkaset lat, ponieważ siedemnastym osiemnastym dziewiętnastym wieku rośliny były zbierane w ten sposób zabezpieczone i dzięki temu my na dzień dzisiejszy dysponując tymi zbiorami możemy np. prześledzić dzięki chociażby odkrywczą genetycznym jak kreśli także wędrowały to jest taka dodatkowa dodatkowa ciekawostka, ponieważ mają rośliny, które były zabrane powiedzmy 200 lat temu możemy wypolerować kody dna, a i w oparciu o kody dna i prawne ciekawe rzeczy wskazać dodatkowo zielniki dają nam informacje, jakie rośliny, gdzie występowały, bo przykładowo zbieracze, którzy budowali te silniki przez dziesiątki lat zaznaczali, w jakich miejscach dane okazy zostały zebrane opisała to jest na odpowiednich kartach i dzięki temu możemy wskazać, że dana roślina powiedzmy 200 lat temu 100 lat temu dziś występowała obecnie już tam nie występuje oczywiście, że w zbiorach naszych wynikowych mamy nie tylko te typowe takie suszone rośliny, ale mamy także szereg roślin okazów, które są przechowywane w specjalnej nazwijmy to formalnie na, gdzie przykładowo kwiaty storczyków waty takie zbiory na 1jedna z ciekawszych na świecie ma Uniwersytet Gdański i właśnie one też będą digitalizowane mam ma ma zbiory starcie kołatek całego świata i kwiaty storczyków są przechowywane w specjalnych pojemnikach specjalnych płynach, zachowując swoją taką nazwijmy to świeży, dlaczego powiedzmy te zbiory są digitalizowane, żeby obecnie przejrzeć te zbiory no trzeba się udać po pierwsze, fizycznie do takiego silnika trzeba dostać zgodę kuratora takiego silnika, bo nie każdy ma nie każdego się wpuszcza do takich wyników ze względu na wartość zbiorów głównie mają dostęp do tego naukowcy natomiast Polsce frezowanie też zbioru metę te eksponaty jesteśmy w stanie wystawić na zewnątrz, a więc każdy będzie mógł poprzez internet wejść w to zbiory i sobie przejrzeć i tutaj też taka ciekawostka że, przygotowując te zbiory do udostępnienia cyfrowego będą one dostępne w 3 rozdzielczościach, bo zupełnie inną rozdzielczość będą potrzebowały i naukowcy pani bardzo wysoką rozdzielczość, bo będą chcieli pewne specyficzne cechy na roślinie obejrzeć zupełnie inną rozdzielczość przykładowo ktoś, kto przegląda wiemy, że ze względu na prędkość łączy jest dosyć istotne, bo duże zbiory dusz obciążają internet i woli to ewentualnie funkcjonuje pani profesorze mówi pan o dużych zbiorach, żebyśmy mogli sobie wyobrazić jak duże to są zbiory to może coś pan powie o liczbie okazów, które wejdą w jej skład my w ramach projektu, które jest realizowana w ramach Polski cyfrowej w ramach ścieżki udostępniania zasobów nauki w tych 3 ośrodkach, a więc Uniwersytet szczeciński Akademia Pomorska w Słupsku oraz Uniwersytet Gdański zdigitalizowane zbiory 4 herbami bezpieka bożka mamy 3 uczelnie, ale 4 Serbia, ponieważ w Szczecinie mamy 2 Herba aria jednak herbarium jest to Herbalife, które w, którym są zgromadzone zbiory okrzemek taka ciekawostka okrzemki to są takie organizmy jednokomórkowe, które odpowiadają za 13 planu produkcji na świecie okrzemki mają jeszcze 1 ciekawą rzecz to jako taka ciekawostka m.in. jeżeli będziemy potrafili odpowiednio rozpoznać okrzemki możemy wskazać co się np. w niedalekiej odległości od tych odsetek znajduje przykładowo, jeżeli mamy książki nad dna oceanu przyznaje, że chora to możemy z jakich tam prawdopodobieństwem, jeżeli wy określona grupa książek występuje wskazał, że tam występują tak jak i inne minerały, a więc jest to także duża wartość gospodarcza tego typu informacji, że pierwsze takie badanie może nam sygnalizować o to może być teren, gdzie mogą znajdą zdawać takie czy inne czy inne minerały to jest i 1 zbiór baraniny na Uniwersytecie szczecińskim drugi zbiór Herba line na Uniwersytecie szczecińskim to są m.in. zbiory, które były budowane ciesz albo pastorów albo aptekarzy, bo najczęściej tą częścią nauki zajmowały się ludzie, którzy wg ówczesnej definicji w ogóle nie byli naukowcami tylko byli powiedzmy ludźmi bardziej doświadczonymi dużo zbiorów właśnie tworzy tworzyli pastorzy tutaj też mamy bardzo ciekawą sytuację takie zbiory mamy w Karbali ją w Słupsku tzw. zielnik darłowski dzielni darłowski jest to powiedzmy taka książeczka, których są suszone okazy roślin, które mają właściwości trujące dla zwierząt i pastor, który mieszkał na tych ziemiach zresztą on badał roślinność jest bardzo uznany w obszarze nauki m.in. prawdopodobnie dorabiał sobie do życia ten sposób, że produkował takie książki, która dostarcza do ówczesnych szkół nazwijmy to podstawowe gimnazjalne i ten konkretny zielnik darłowski, który został odnaleziony po drugiej wojny światowej przez przypadek jest opisane, że jest to książka, która była wykorzystywana przez szkołę żeńską w Słupsku i były tam uszu usłyszane rośliny dokładnie opisane jak wyglądają, jakie negatywne skutki zwie zwierzęta ewentualnie są też inne zbiory ludzie mogą mieć po spożyciu i co należy podać takiemu zwierzęciu czy człowiekowi, jeżeli taką roślinę nieopatrznie skonsumuje, a więc to jest też ciekawy ciekawy przykład, że takich rzeczy wtedy uczono, żeby umieć rozpoznać, jakie to są rośliny jakie, jakie one mają właściwości i ewentualnie, jeżeli mają negatywne właściwości na życie człowieka czy zwierząt jak stosować jako odtrutkę i to jest wszystko opisane na tych kartach zielnika darłowskiego jest bardzo ciekawy dzieci ciekawy ciekawy element, który pokazuje że, że w tej chwili nie uczymy dzieci czy mniejszym zakresie chociażby, bo październik, który rozpoczęliśmy naszą rozmowę, gdzie chodziło się do parku zbierało się liście usłyszało to między suszy się oczywiście m.in. po co to było, żeby każdy z nas miał więcej rozpoznać drzewo czy po liściu czy ewentualnie po korze drzewa jego ogólnym oglądzie tak samo jak powszechne było umiejętność rozpoznawania powiedzmy zbierania grzybów, które są jadalne czy, które nie są jadalne, jakie owoce zioła, jakie mają właściwości, a więc te kompetencje były przekazywane w szkołach na tyle na nas na to świadczą m.in. tak tego typu zbiory jak zielnik zielnik darłowski są jeszcze 2 dzielniki i z tego co wiemy na ich temat to łącznie wszystkie 3 wyższe uczelnie mają 468 000 zachowanych okazów w ramach tych 4 rzeźników czy coś na temat tych 2 pozostałych silników mógł pan jeszcze nam opowiedzieć tak m.in. w Gdańsku ma w silniku w Gdańsku osoby zbiory tak jak wspomniałem z całego świata jest rośli z tą tylko waty zespół profesora szlachecki z Gdańska ma także tzw. zbiory referencyjne jest też bardzo istotne, że warto silników jest m.in. oceniana przez fakt, że występują zbiory referencyjne okaz referencyjny jest okaz, do którego wszyscy inni badacze porównują dane dany okaz, a więc on jest takim wzorcem ser ze swojej w swoim gatunku to jest to jest też o wartość dzielnika tutaj dodam jeszcze że, realizując projekt Polski cyfrowej Barbary po baranku bardzo nam zależało im tutaj m.in. ten element związany z z tym cyfrowe udostępnianie, żeby po stworzeniu całej infrastruktury otworzyć ścieżkę możliwości łączenia się innym silniku z całej Polski takie hasło kreujemy od barw pomarańczy w kierunku herbarium poloników i m.in. rozwiązanie, które zostało nam dostarczone wyniku postępowania w oparciu o przez publiczne przez firmę HPE pozwala nam w sposób elastyczny rozbudowywać o sferę informatyczną dodam, że koncepcja, żeby zapewnić sprawność funkcjonowania serwerownie są umieszczone w 3 ośrodkach i one się backupu ją na zasadzie automatu tak no standardem jest to, że główną serwerownię tą podstawową serwerownia na Akademii Pomorskiej w Słupsku serwerownia na Uniwersytecie gdańskim Survey Survey erozją, która z automatu robi kopie zapasową natomiast serwerownia Szczecinie także zachowuje kopię zapasową jako element zwiększający bezpieczeństwo zdigitalizowanych zbiorów, a więc 3 serwerownie one się automatycznie widzą i rozwiązanie też dostarczone przez firmę HP pozwala nam to, że w wypadku jakiejkolwiek awarii 12 ciecz no, jakby szyna nagle nam wysiadły serwerowni to niestety ma obowiązek dostarczyć udostępniać, ale umieszczenie powiedzmy zbiorów szef serwerownia, które są oddalone od siebie niezależne, ale widzą się wzajemnie dzięki temu rozwiązaniu automatycznie w wypadku jakichkolwiek problemów się druga serwerownia przejmuje zadania, a oprócz tego rozwiązanie możemy rozbudowywać wypadków włączania zbiorów o kolejne zbiory Herba line myślę, że to jest też dosyć istotne, ponieważ to pozwala myśleć innym herbarium o tym, żeby się skupić na procesie digitalizacji, czyli skanowania, a nie budowania infrastruktury informatycznej do udostępniania my chcieliśmy, żeby inne ośrodki akademickie, które mają zbiory awaryjnej mają także bardzo ciekawe bogate miały możliwość włączenia i udostępnienia poprzez to to naszą Platformę niejako na cały świat dostęp to do tych zbiorów będzie bezpłatny nie ma żadnych opłat natomiast, toteż jako taki taki element oczywiście nie wszystkie informacje będziemy udostępniać online, a techniczne rzeczy ja jeszcze chce też podpytać drugiej części audycji także prosimy słuchać chwilę cierpliwości wrócimy po informacjach, a naszym gościem jest dzisiaj prof. Piotr Niedzielski z Akademii Pomorskiej w Słupsku oraz z Uniwersytetu szczecińskiego rozmawiamy o projekcie pierwszego cyfrowego zielnika herbarium Pomeranii com zapraszamy zaraz po informacjach Radia TOK FM na drugą część naszej rozmowy witamy państwa ponownie druga część audycji Homo science Aleksandra Stanisławska Piotr Stanisławski Crazy nauka PL jest z nami nasz gość prof. Piotr Niedzielski z Akademii Pomorskiej w Słupsku oraz Uniwersytetu szczecińskiego dzień dobry ponownie także ponownie witam państwa rozmawiamy o bardzo ambitnym projekcie cyfrowego zielnika chodzi o to, żeby zdigitalizować udostępni i co najważniejsze naprawdę potężne zbiory, bo w sumie 4 silniki należące do 3 pomorskich uczelni partnerem technologicznym tego jest firma Hewlett Packard Enterprises, która tu zapewni infrastrukturę właśnie od infrastruktury rozmawialiśmy o systemie serwerów wakatów, które zapewniają lot będzie stabilność pracy tego całego rozwiązania, ale też bardzo ważne, o czym pan mówił o możliwość dołączania kolejnych silników, jeżeli kolejne uczelnie kolejne zbiory będą chciały tu się włączyć to ja chcę zapytać na początek na jakim etapie w tej chwili prac jest cały ten dzielnicy już coś można zobaczyć co się w tej chwili dzieje obecnie jesteśmy po wyłonieniu nazwijmy to dostawców zarówno sprzętu do skanowania ponieważ, żeby skanować trzeba było wyposażyć uczelnie specjalne skanery nie są takie zwykłe zwykłe kamery skanery wysokiej rozdzielczości dostosowane do tego typu tego typu rozwiązań część okazów silnikowych tak jak wspomniałem chociażby okrzemki tam wykorzystuje się mikroskopy odpowiednio dużej rozdzielczości, które pozwalają zobaczyć te zbiory także tutaj są różnego rodzaju technologie skanowania inaczej dokonuje się digitalizacji okrzemek inaczej dokonuje się digitalizacji tych tradycyjnych zasuszony, ale etatów inaczej do dokonuje się skalowania grzybów one są bardziej przestrzenna czy też chociażby jak to koledzy nazywają tych preparatów, które są z chociażby kwiaty w zanurzone w odpowiedniej cieczy tzw. pikle to trochę tak domowego o żartobliwie, ale to oddaje istotę, że to są właśnie skanowanie PIT jest też bardzo skomplikowane, ponieważ należy wyjąć taki preparat odpowiednio, bo on musi się osuszyć pójdzie z powrotem musi trafić, żeby zachował swoją to swoją powiedzmy świeżość wyglądu, mimo że mają one po kilkadziesiąt po po kilkadziesiąt lat, a więc każdy każdy każdy przy przy digitalizacji muszą być odpowiednie urządzenia, które pozwolą tego typu tego typu zbiory cywilizować dodatkowo także cywilizowane oprócz takich na rzeczywistych nazwijmy to roślin czy organizmów cyfryzacji będą podlegać także część literatury, ponieważ mamy np. opracowania naukowców, które mają po to, parę lat to też jest istotne źródło informacji o zbiorach czy zasobach naturalnych, które występowały także nie tylko, ale Gatty związane z roślinami czy z organizmami do jakiej grupy chociażby te jednokomórkowe okrzemki można zaliczyć, a w takim razie, kiedy będzie można zacząć korzystać z tego, gdzie zielnika i kto będzie mógł zrobić może najpierw, kiedy myślę, że uda nam się wystawić te zbiory z początkiem przyszłego roku tak mniej więcej z harmonogramu to wynika, ponieważ pierwsze było zbudować infrastrukturę, a więc wyposażyć urządzenia do skanowania doposażyć serwerownie odpowiednie serwery, które będą te zbiory przechowywać to są rzeczywiście duże zbiory jesteśmy także na końcówce kończenia aplikacji, która będzie na zewnątrz wystawiać na razie można można zobaczyć co się dzieje projekcie poprzez odwiedzenie np. strony internetowej herbarium Pomeranii com natomiast w momencie zakończenia tych prac związanych z infrastrukturą informatyczną i z zakończeniem prac związanych z aplikacją, która będzie to na zewnątrz wystawiała to każdy uczestnik będzie mógł wejść sobie na portal herbarium pomarańcz com i wg różnych masek możliwe czy haseł kluczy poszukać sobie określoną roślinę wg różnych nas może będzie mógł poszukać sobie w jakim obszarze danej rośliny mogą występować i tutaj też takie małe zastrzeżenie zdając sobie sprawę, że udostępnianie takich informacji wiąże się także z pewnymi ewentualnymi negatywnymi konserwy konserwy akcjami np. pod nie będziemy podawać dla zwykłego użytkownika dokładnie dokładnej lokalizacji może taką mamy zabiegał o lokalizacji występowania siedliska danego danej rośliny, ponieważ tobyśmy sprowadzali nieszczęście na te rośliny, bo każdy wiedział chcący taką roślinę dalsze, gdzie szukać no ale chcemy, żeby wszyscy za deptali, że zapowiedź zwolnień zerwali zerwali te roślinne wzory własnych prywatnych zbiorów prawda, a ja od razu się zapytać do czego można wykorzystać takiego naukowego punktu widzenia taką kolekcję, bo oczywiście bardzo przyjemnie przejrzeć o sobie prawdę o 3 nie mogę doczekać bardzo z tym ciekaw tych grzybów i tych szpitali i drzemki i okrzyków, ale rozum ma wartość naukową czy to może służyć teraz Mączka takie zbiory właśnie pan powiedział dość stary nawet mający kilkaset lat jakimś bieżącym odkryciom naukowym oczywiście, ponieważ przewidujemy to jest w ramach współpracy ośrodków naukowych, bo to jest 1 grupa interesariuszy naukowcy tak oni na pewno bardzo dobrze wykorzystają przykładowo, jeżeli będą poszukiwali określonej w określonej rośliny tak zobaczą, że u nas zbiorach mamy taką roślinę mogą np. zwrócić o preparowanie do nas o kod dna i w oparciu o swoje badania, bo skupiają się na danej roślinie zobaczyć czy występowanie tej rośliny np. na Pomorzu jest w jaki sposób powiązane z występowaniem tej rośliny winnej części powiedzmy Europy, a więc tutaj te możliwości napęd na pewno są w świecie nauki, a więc oto my jesteśmy jak najbardziej spokojni naukowcy wykorzystają oni wiedzą, ale inną grupą interesariuszy to mogą być chociażby z Trzciela celnicy celnicy mogą sprawdzić w ten sposób jak mają podejrzenie czy ktoś, wywożąc z wakacji jakieś rośliny czy one nie podlegają w jaki sposób w sposób szczególny ochronie, gdzie występowały czy na danym terenie mogły być tak, bo mogą to być powiedzmy projektanci inwestycji, którzy przygotowują np. inwestycje strzelam budowę jakiejś fabryki czy na danym terenie nie występują jakieś gatunki chronione związane z roślinami tak rozumiem, że tam będzie jakiś przyjazny użytkownikowi system wyszukiwania tak, żeby no, bo powiedzmy celnicy nie są botanika ami, więc potrzebują jakiegoś no nie wiem klucza jakieś metody przeszukiwania tego tak ma być bardzo przyjazny, ponieważ kolejną grupą to interesariuszy to chociażby nauczyciele oraz uczniowie szkół np. podstawowych tak że, przygotowując powiedzmy te tradycyjne silniki, które my robiliśmy w szkole podstawowej mogą np. także spróbować dostać takie zadanie, żeby ściągnąć, jakie okazy danej rośliny, którą należy np. w parku znajdują się np. w silniku to dodatkowe zadanie może być dla takiego ucznia do wykorzystania że, budując ten zielnik wzrośnie, które ma nazwijmy to w swoim najbliższym otoczeniu, żeby jeszcze wskazał 3 takie rośliny jakieś informacje z tego typu silnika, więc tutaj dla różnych grup interesariuszy i to ma być także przyjazne dla laika tak jak ja nie jestem botanikiem dla przy projekcie bardzo dużo ciekawych rzeczy się nauczyła i to bardzo nas cieszy, bo my też jesteśmy specjalistami już się nie mogę doczekać, żeby to móc przeglądać bardzo dziękujemy za pana wyjaśnienia i zapraszamy na stronę herbarium Pomeranii już teraz już teraz razem pisane kropkę PL tam można śledzić postępy prac nad tym silnikiem cyfrowymi później będzie można tam skorzystać ze zbiorów zdigitalizowanych i dziękujemy za opowiedzenie o tym zielnik ku naszemu gościowi prof. Piotrowi Niedzielskiemu z Akademii Pomorskiej w Słupsku oraz Uniwersytetu szczecińskiego dziękujemy bardzo dziękuję bardzo, zapraszamy państwa na stronę właśnie kraju zapowiedziała, czyli herbarium Pomeranii cum, ale też zapraszamy jak zawsze na Crazy nauka PL tam będziemy informowali, kiedy już ruszy ten dzielnik także był każdy mógł zobaczyć no cóż co tydzień zapraszamy na naszą audycję, a teraz czas na informacje Radia TOK FM Zwiń «

PODCASTY AUDYCJI: HOMO SCIENCE

Więcej podcastów tej audycji

REKLAMA

POPULARNE

REKLAMA

DOSTĘP PREMIUM

Podcasty TOK FM oraz radio TOK+Muzyka bez reklam - teraz 60% taniej w promocji Black Friday!

KUP TERAZ

SERWIS INFORMACYJNY

REKLAMA
REKLAMA
REKLAMA