REKLAMA

Do czego mogą nam się przydać bakterie z Antarktydy? O ich ożywianiu i badaniu mówi Mikołaj Fedorowicz

Przedpołudnie Radia TOK FM
Data emisji:
2018-07-18 10:20
Prowadzący:
Czas trwania:
25:04 min.
Udostępnij:

AUTOMATYCZNA TRANSKRYPCJA PODCASTU

Transkrypcja podcastu
rząd 2 5 Karolina Głowacka teraz trochę naukowcem Mikołaj Federowicz studia dzień dobry dzień dobry Instytut Biochemii Biofizyki Polskiej Akademii Nauk czy na Antarktydzie jest dużo życia na Antarktydzie na on nie powiedziałbym w PRL władza się przyjrzeć się w jakby tak się przejść wobec na pewno są ekspedycję na Antarktydę to można zaklasyfikować, jako że nie wszyscy natomiast, jeżeli chodzi o Antarktydy jej do koła, czyli Antarktyka to wyspy, które są dookoła to Rozwiń » tam jest on jak życie kwitnie tylko, że troszeczkę inne takie życie niż jesteśmy przyzwyczajeni do tego na co dzień co marzyć czytać akta znaczy najwięcej jest oczywiście bakterii na bok bakteria to są takie, że piątka co oni potrafią przeżyć Holandia kiedyś ludzie myśleli, że w niektórych miejscach na ziemi na to pewnie się ich nie znajdzie, bo tam są za trudne warunki do życia okazało się, że nie na sobie bardzo dobrze radzą zimnych woda w in przy lodowcu dach czy jakiś krewetka czy innych skorup pijaka, który też żyją w okolicach Antarktydy, czyli sprawa trudnych warunków do życia jest raczej względna no tak to co dla nas jest trudne może się okazać zupełnie przyjemny dla takich właśnie bakterii, ale oczywiście specjalne zagadnęłam bakterie wypłynęły też bardzo ciekawe ich tam jest dużo tych bakterii wiele gatunków spocone tam żyją nie mogą też 10 stron przyjemniej znaczek już wcześniej mówiliśmy to wszystko zależy od tego jak zdefiniujemy przyjemnie takie bakterie, które żyją w takich warunkach nazywają się ekstrema chwilami no jak to wszystkie trudne słowa to składa się z 2 mniejszych nowe ekstremum w jak sam, grając dobrze jest skrajne, że Toruń skrajne warunki tutaj wchodzą w grę i ta filia, czyli po prostu lubią przebywać w takich warunkach i ona po prostu nie rosłyby tam, gdzie byłoby im cieplej czy miałyby takie warunki idealne dla nas czy jest ich dużą nową szacuje się, że takie bakterie, które są zimne lub dna to jest największa grupa takich bakterii oraz szans na tak, bo jeżeli chodzi o oceany n p. oceny zajmują 3 4 naszej planety to 90 % to za nos jest tak naprawdę zimna nam się kojarzy, że to jest takie tropiki palemki, a to nie większość dostałbym na roczne zimne wody i tam bakterie jest mnóstwo rozmawiano o tym, dlatego, że Mikołaj Fedorowicz przebadał takie bakterie właśnie zimna nudna, ale sam się wybrałem się na Antarktydę Antarktyki trzeci przywieźli niestety nie nie wybrałem się na, aczkolwiek cały czas nie chodził po głowie, że może się zapisać dane GUS oraz relacje tak jak bardzo chciała na tak powiem tak to były dosyć stary projekt, bo w tak w połowie lat dziewięćdziesiątych ubiegłego stulecia polskie zespoły badaczy zaczął zbierać próbki właśnie tu natomiast słusznie zebrał Jan zabezpieczył przez likwidację to jest taki proces, gdzie się pozbywamy wody z komórek jednocześnie ma rodzinę, żeby one zostały Lotosu taka wydmuszka została co tu badać potem na bok potem mierzyli się Doda wody z solami fizjologicznymi to takie bakterie potrafi ułożyć poważnie naprawdę zmartwychwstanie takie porządne dlatego to było fajne o tyle jednak przy w, czyli znaleźli bakterie koledzy dokonali finalizacji taki jest wiele wandali tak podstawową są takie testy gdzieś patrzy czy takie bakterie potrafią wykorzystywać jakimiś związki jako źródło węgla czy jakie one mają właściwości natomiast było kilka takich testów a, ale nie byliśmy w stanie na podstawie nich w ogóle powiedzieć co to za bakteria dopiero po kilka, bo inna 10 0 latach okazało się, że to tato tato tato kolekcja tych bakterii została przekazana z zakładu biologii Antarktyki do Instytutu biotechnologii antybiotyków, do którego ja przyszedłem rok teraz razem ze środy jest żądanie w szafie znalazł i powiedziała zapomnieliśmy przebadać szczerze mówiąc myślę, że po prostu tego było, tyle że zakład zaczął się dzielić zabrakło doktorantów znacie ja wiem, że na pewno ich zakłady na Uniwersytecie warszawskimi właśnie tutaj w IBA też pracuje się na tych bakteria, więc myślę, że było, tyle że trzeba było dzielić bliźniego, żeby nie należało, iż nie marnowały dobrze i trafiły one rozwój na twoje biurko i co dalej i co dalej no takie bakterie na początku trzeba było ożywić to znaczy brałam sobie to około, bo rurka szklaną zamknięto szczelnie z 2 stron i warunkach sterylnych pod takim wyciągiem z Realem na pewno nic nie będzie wylatywał o 1 na początku pod drzewem to rurkę niewiadoma, jeżeli coś się podgrzać, a potem szybko się ochłodzi to to panikę no dokładnie to robiłem potem zawieszam w tym roztworze soli fizjologicznej, żeby to się dobrze tam rozpuściła, gdy przenosiłem na taką stereotypową płytkę Schalke z pożywką dla Rz znamy z, bo tak się kojarzone na ulicy jest natomiast o tyle było to on inna od takiego typowego ty typowej pracy mikrobiologia żelem po pierwsze, ta szajka miała dodatkowe i miała na pożyczkę z podwyższoną zawartością soli no bo wzrok w marcu 2 wojnie o siebie tanio dokładnie, a po drugie, zamiast takiego wielkiego inkubatora, który dał nam trochę pokręteł i trzyma to 3 7 stopni, żeby bakteria dobrze się rozmnażały twój rozmnażały rozmrażać w trochę narażało to w latach ja dostałem lodówkę, a mama 15 stopni to jest to co takie bakterie lubią no to właśnie rosło sobie w lodówce tak naprawdę lubię 15 stopni w końcu są z zimnych terenów to co już upały dla nich go nie były trochę zirytowany, że została obudzona do życia ponownie tu wywiezione porwany ze swoich terenów co znaczy to jest tak, jeżeli chodzi o takie typowe typowo definicja co mówisz, że to bakterie zimno lub na to mają najlepiej im się rośnie poniżej 15 stopni i nie rosną już powyżej 2 Jazz tu w zegar co tak natomiast są jeszcze takie zimno tolerancyjna, które rosną tu mogą urosnąć poniżej 5 stopni, ale o kim mają tak w granicach 20 2 5, ponieważ nie wiedzieliśmy dokładnie co jest w środku tych rurek no to wybraliśmy 15 stopnia kąt mniej więcej pośrodku, że może nie będzie to idealna temperatura dla żadnej grupy natomiast załapie się w te widełki, które chcą urosły o pasły się urosły More mogę powiedzieć tak dorosły pasły się następnie jakieś takie bakterie urosły to on trzeba było sprawdzić czy ona w środku coś ciekawego mają akurat to laboratorium, w którym ja robię pracę magisterską zajmowało się bardziej genetyką, czyli wyjmowaliśmy go za pomocą takich komercyjnie dostępnych zestawów klas midi z tych bakterii co to takiego no właśnie prezydent są niezwykle ciekawe cząsteczki dna, które są u w bakteriach one nie są im niezbędna do życia to jest taki bonus w natomiast dla tych klas mitach często są zapisywane jakieś dodatkowe cechy, które są bardzo przydatnym bakteriom mało tego bakterie mogą się takimi zmianami dzielić ale kto dziedziczy mnie to teraz nie jest potrzebna weź sobie to ty w znacznym dna może się nam nasz związek żali się namnaża takie taki plan zmian to jedno bakteria może przekazać tylko kopie to drugi jej stan się bierze n p . problem z Antonim wiele antybiotyków oporność u to w tych plazmy idę właśnie jest odpowiedź na to, że się uczą odporności na antybiotyki tak znaczy to wygląda także, jeżeli mamy jakąś bakterie, które jest oporna na jakiś antybiotyk na jej wystrój jamy wszystko inne to nasze inne narzędzia no i wtedy mamy dużo tej bakterii, które jest oporna Tena antybiotyki, jeżeli nas spotkać się z jakąś inną to być może mogą się wymienić to nie jest także zawsze wszyscy ze wszystkimi tam się wymieniają terminal w jakiej zasady obowiązują obiecanych dobrze, czyli plazmie, gdy to jest teraz są cząsteczki dna z takimi bonu sowy mi fajnymi cechami i co z tymi trendami w East chodzi o swoje bakterie i zostanie plac Midan na początku trzeba było je wyizolować znaleźliśmy kilka wybraliśmy się z promotorem 1, który będziemy badali naj trzeba teraz była jakaś żmudna wiedzie się tak właśnie zaczęliśmy główkować no to jak nie wiadomo jak nie wiadomo czy coś zdziałać nie działa to najlepiej przyłożyć młotkiem w nas robiliśmy coś podobnego, jeżeli chodzi o biologii molekularnej, a mianowicie wzięliśmy takie enzymy, które tchnął w specyficznych miejscach to dna 3 najbardziej takie popularna piłki postanowiliśmy, że zobaczymy czy to cieknie nam te ten plac nic tak to ich dzieło właśnie 1 z 3 okazało się, że pociągną natrzeć lub części, więc potem można rozdzielić takie fragmenty dna na żelu neony sobie rozdzielają się ładnie z polu elektrycznym i wyciąć sobie taki fragment alei szympansy, odkąd skalpelem naprawdę w naprawdę znaczy to chodzi oto dna jak sama nazwa wskazuje z kwasem on ma ładunek elektryczny no, jeżeli się wrzuci go do takiej studzienki i żalu i włączyć prąd to zacznijcie od 1 elektrody do drugiej natomiast, że mamy żal no to on jest dłuższy kawałek ten zwalnia i tutaj się na moment zetrze mamy państwo pewnie myślał, że my tutaj opowiadamy o taki lot tam sobie badania, jaki się bakterii ginie oczywiście, że można zastosować się to, czego Mikołaj Federowicz się dowiedziała, przyglądając się bakteriom z Antarktyki Instytut Biochemii Biofizyki pan to jest instytucja, w której Mikołaj teraz pracuje dziś do 3 7 za chwilę do państwa wrócimy w porannej informacji o sąd 4 2 wracamy do naszej opowieści o bakteriach Zan taktyki, która bada Mikołaj Federowicz z Instytutu Biochemii Biofizyki pan dzień dobry raz jeszcze 1 dobry oraz wtórnej co tam się udało dowiedzieć po tych wszystkich zabiegach po dokonywaniu procesu zmartwychwstać tym wania w rynek to określić mecz już czekam na mecz do państwa fakt, że decyzja źle co powiedział dobrze płatne w każdym razie, kiedy już udało się przywrócić do życia i przebadali istnieje to co mam też, że to jest nic takiego ciekawego wyszło nam, że posiadają rzeczywiście 11 posiada plazmie, gdy posiada je udało nam się poznać ich sekwencje przez to, że właśnie jak mówiłem po fragmentach podzieliliśmy na fragmenty dosyć losowo, a potem za pomocą takich zabiegów z biologii molekularnej poznaliśmy te sekwencje fragmentów potem to połączyliśmy w całości my postanowiliśmy porównać czy ta jest podobna do jakiejkolwiek z tych właśnie sekwencji plazmy dr już jest w bazach danych i okazało się, że kompletnie jak oni ze i co teraz z 1 strony w takiej sytuacji no właśnie dno z 1 strony to mieliśmy takie odkryliśmy coś nowego Super z drugiej strony na dobra, ale co z tym dalej zrobić my właśnie tutaj postanowiliśmy pooglądać mikrobiolog w takiej sytuacji mikrobiologii albo sam sam siada do komputera albo jedzie do bio informatyka w ich wtedy za pomocą tej sekwencji, którą mamy sprawdzone czy tam są pół n p. jakiejś otwarte ranki odczytu, czyli takie miejsca, w których wiadomo, że znaczy podejrzewam, że jest zakodowany jakiś gen jakieś białko my wtedy my znamy kod genetyczny to komputer jest w stanie nam przetłumaczyć to na białko no i wtedy możemy porównać to białko jest do czegoś podobne notowań wtedy to już jest w wiadomo już jest jest też wzrost na rzekach i zrobiliśmy to on w tym, jeżeli chodzi o ton plazmy którymi się zajmowałam i okazało się, że rzeczywiście są 2 białka jedno to jest najprawdopodobniej takie znaczenie najprawdopodobniej, bo nie chcę mówić na pewno są gotowi negatywną co nie działa najprawdopodobniej z jedno białko, które nie powoduje to, że łatwiej się właśnie takim plazmę dom rozchodzić albo jak coś jak jest zimno to mniejsze rzeczy rozpadają, więc jeżeli chcemy oddzielić od siebie takie klasy windy, które się nam należały, który się podwaja ma na to potrzeba jest jakiś biały, który pomoże impulsu de ta mordercza i właśnie to najprawdopodobniej do takiej białko było zakodowane tam natomiast drugie okazało się być całkiem o nieznanej funkcji w naprawdę zobaczyliśmy oka jest do gmin do czegoś podobne wchodzimy do bazy danych Atu rodzina białe konie znanej funkcji i nie wie co do tej pory czy już wiecie co to takiego no nie do końca wiemy ja, a niestety nie miała już w czas na studiach magisterskich, żeby poprowadzić te badania dalej natomiast wiem, że właśnie w Instytucie biotechnologii antybiotyków są ludzie, którzy próbowali właśnie n p. zwrócić przenieść ten plazmy do innych bakterii zobaczyć, jakie mam inne właściwości natomiast to nie jest takie proste, jeżeli to jest kompletnie coś nowego przy to jak teraz jestem podatnikiem, który mówi ja tu płacę mu jak Ławica idzie na to, żeby jakiś Mikołaj Fedorowicz szerzej dłubał bakterie, a potem powiedział, że nie wie co tam znalazł tymczasem mamy niespodziankę, bo jednak jest pomysł na zastosowanie tak znaczy pomysłów na zastosowanie jest mnóstwo, bo jak już wcześniej mówiłem plazmie wykonują białka białka mogą być enzymami, czyli takimi substancjami, które przyspieszają jakiś reakcje i tak enzymy pochodzenia właśnie takiej bakterii zimno lub innych mają 3 zasadnicze zalety po pierwsze, jak już wcześniej powiedziałam, jeżeli coś za przebiega w zimnej temperaturze to najczęściej to jest ta reakcja zwalnia się, mówi że od, jeżeli obniżymy temperaturę od 10 stopni to od 2 do 4 × wolniej przebiega jakaś reakcja i w związku z tym zamek, który działał w niskich temperaturach muszą działać bardziej bardziej być wydajne tak mówiąc już technologicznie na niej wtedy można otrzymywać jakieś takie enzym i stosować go mniejszą ilość albo z mamą oszczędność mamy oszczędności, ale w laboratoriach czy my w kuchni w pralni tym można, bo albo w laboratorium można oczywiście mocny powiedzmy sobie sprawę dużo rzeczy, które odkrywają biolodzy co z psami wykorzystują natomiast nie wszystko nie jesteśmy aż tak samolubnie na pewno możemy wykorzystywać to przemyślan n p . jest taki enzym z żelaza, który się wykorzystuje w piekarnictwie dodaje się do mąki rzeźbione steki steki gorszej jakości i to pomaga natomiast to, że one działają w niskiej temperaturze to jest z Terenzano to jest druga taka na zalega funkcjonalną zaleta, która może być wykorzystywana jest to już się bliżej ludzi, ponieważ można przeprowadzać wtedy takie reakcje w temperaturze zbliżonej do pokojowej nie trzeba nam n p. specjalny podgrzewacz czegoś, ale to co n p. pranie w 30 stopniach to zła wyniosły elementy tak dokładnie co znaczy na początku to wyizolowano takie właśnie enzymy od bakterii i zimno lub innych teraz to się już częściej próbują modyfikować znane jakieś inne enzymy, żeby one nabyły tej rangi tych możliwości pracy w niskich temperaturach natomiast też inne płyny do czyszczenia szkieł kontaktowych, bo przecież usuwamy ten cały wrzątkiem nie chcemy raczej nowy rząd Chin chcemy zaangażować nie chcemy, żeby one były brudne natomiast masa jakiś film właśnie zanieczyszczenie naszych oczu jej palców, jakie zdejmujemy znali go tam też właśnie nie gotujemy ich przez nas tylko zostawiamy w takim wpłynie na jej to jakoś działa mam podobno też można wykorzystać odkrycia i w zorientowanie się jak działające ciekawe bakterii przy oczyszczaniu wód tak, bo on jak już wcześniej mówiłem większość dziś zawód stan oceanicznych jest zimna, więc jeżeli chcielibyśmy wykorzystywać bakterie przez oczyszczaniu jakieś plamy oleju 3 właśnie liście leków, które wypłynęły do takich wód to rzeczywiście są bakterie, które potrafią rozkładać jakieś związki organiczne węglowodory natomiast nie wszystkie potrafią przeżyć właśnie w takich zimnych temperaturach, więc albo musimy nauczyć zwykłe bakterie to znaczyć zwykła znane nam jak sobie radzić w zimnych temperaturach albo znaleźć takie, które już sobie z tym są w stanie z tym poradzić być może rozkładają te związki organiczne, ale jeszcze ich nie znamy w akcie wątek zagadać w ogóle bakterie, bo chciałbym się dowiedzieć od ciebie ile jest w ogóle gatunków bakterii czy też ile wiemy, o ile wiemy, a raczej zapytać czy stosowanie pojęcia gatunek wobec jedno komórkowych istotne jest w ogóle zasadne macie tak, jeżeli chodzi o gatunki co ja mogę powiedzieć, że ten film wiele wiele wiele znaczy to jest największa grupa organizmów w ogóle z tego co mi wiadomo, jeżeli chodzi o takie różnice w zróżnicowaniu natomiast no właśnie, jeżeli chodzi o bakterie to częściej używamy sformułowania sztab, że to jest taka podstawowa jednostka, dlaczego bomb bakterie no jak to organizmy jednokomórkowe mają bardzo dużą zmienność to znaczy tam, jeżeli zajdzie jakaś mutacja czy właśnie nowy plac nic bakteria pozyskałem komórka to już ma nowe cechy i zarazem Potez mówimy o osobnikach można powiedzieć coś takiego nie bardzo zależy możliwość hamujące pojęcia, które znamy z takim makro biologii no tak, bo to w na jak mówią to jest już taka mała skala, że to nawet niewielka zmiana powód może spowodować jakąś zmianę w bakterii i wtedy mamy coś się kimś innym w no właśnie to bardzo często wykorzystuje się właśnie w biologii molekularnej mówi się od transformacji bakterie, kiedy coś się właśnie jakimiś wymuszonymi metodami wprowadza te plazmy, gdy po to, żeby n p. bakteria produkowała jakieś białko, które nas interesuje co prawdziwe problemy tożsamościowe mogą mieć takie bakterie zamawiającym bakterie mają jakieś żaden bowiem tak problemy cele na jakość zastanawiają się nad swoim życiem natomiast, jeżeli tak śmiało to może jakąś grupę wsparcia zaproponować ceny nikt się robić co znaczy czy jesteś w stanie na oko, by rozpoznać, która bakterie, z którego szczepu czy to wszystko trzeba przebadać genetycznie dziennie na oko nie jestem w stanie powiedzieć, bo to pierwszy bakterie są bardzo małe po drugie, one są bardzo podobne do siebie, jeżeli chodzi o jak w jakikolwiek zaklasyfikowanie właśnie bakterii do jakiegoś właśnie gatunku czy potem jeszcze dalej do szczepu konkretnego to przynajmniej w moim przypadku jak próbowaliśmy się dowiedzieć co to za bakterię stosowaliśmy taką metodę, która nazywa się z bardzo mądrze sekwencjonowanie jednostki 16 SR bosą rybosomy to są takie kompleksy, które składają białka, a tak, aby czytają go to informację genetyczną nam na podstawie tego z wkładają białka co jest w wielkie uproszczenie, ale na razie się tego trzymajmy ją są złożone również z rana czy też takiego kwasu nukleinowego, które można, z którego można poznać sekwencja okazuje się, że on to sekwencja jest bardzo mało podatna na zmianę, więc jeżeli już tam będą jakieś zmiany no to znaczy, że to jest konkretny już jakieś inne obszar, w którym się poruszamy od inna grupa organizmów my właśnie na podstawie tego w pracowni sekwencjonowania tam właśnie zakładu bioinżynierii Instytutu biotechnologii antybiotyków zostało wykonane takie jedno typowania, kto się ładnie mówi inna i porównane te wyniki z bazami danych i dla fajnych rynki wyszły nam wyszło nam takie fajne wyniki wyszło, bo nie wyszło nic to występuje powiedzmy sobie jakiś film w lodówkach czy u nas na rękach, więc na pewno nie zamieściliśmy próbek tak to już zdaje, że to jest dobrze, ale tak na poważnie to głównie mieliśmy takie strzały co do rodzaju tylko my wiedzieliśmy, że jak nie patrzy się na nazwy takie mądre typ bakterii no to wiedzieliśmy, że jest n p. Salomona są rzeczy to jest w Salomon specjaliści Aqua Marina to nie do końca no ale głównie myślimy, że dlatego, że ludzie badają takie bakterie raczej, któremu spotkamy na co dzień Ania tak jest drugiego końca świata, więc po prostu mogło nie być takich wpisów w tym, że za cały świat jest pewnie jeszcze bardzo poważnie nam nieznany tekst deblistek mógł uda się w ogóle oszacować, że wiemy 15 % bakterie 30 5 2 nie chciałbym strasznie jest miasto jest kompetentny do tego, żeby mówić ile to jest procent, bo w już naprawdę wiele razy w nauce było w taki, że da wyraz House 1 lidze już n p. sekwencjonowania genomu człowieka już wszystko wiemy już tam terapia celowana w ogóle dla każdego Okrężnej do ONZ myślano, że wszystko wiadomo wszakże, by stanie powiedział nie w tym grawitację to trochę inaczej niż się wam wydaje nam jej własny na ich terenie nie mówić takich rzeczy, że na pewno już tam 15 % wiemy co w niczym więcej tym mniej nowych Mikołaj Federowicz Instytut Biochemii Biofizyki pan dziękuję bardzo dziękuję bardzo dziesiąte 5 6 za chwilę informacje po informacjach zajmiemy się sprawami sądownictwa w naszym Zwiń «

PODCASTY AUDYCJI: PRZEDPOŁUDNIE RADIA TOK FM

Więcej podcastów tej audycji

REKLAMA

POPULARNE

REKLAMA

DOSTĘP PREMIUM

TOK FM Premium teraz 40% taniej. Wybierz pakiet z aplikacją mobilną - podcasty, audycje i radio bez reklam zawsze pod ręką.

KUP TERAZ

SERWIS INFORMACYJNY

REKLAMA
REKLAMA
REKLAMA